Demuxlet labels all cells of DROPLET.TYPE as "AMB" #81
Description
Dear developers,
We are just about to add the hadge-pipeline (a comprehensive pipeline for donor deconvolution in single-cell data) to nf-core. When running the pipeline on our test dataset (500 cells from two donors), we observed the following:
- Using freemuxlet,
DROPLET.TYPEis assigned as "AMB" for 275 out of 500 cells. - Using demuxlet,
DROPLET.TYPEof all cells (468/468) is assigned as "AMB".
Additionally, the total number of cells appears to be reduced after processing.
Do you have any idea why all cells are classified as "AMB" in demuxlet, and why the number of cells seems reduced? Could you also advise if we might be using the tools incorrectly?
Thank you for your help!
Best,
Luis
popscle dsc-pileup \
--sam test1_sorted.bam \
--vcf donor_genotype_chr21.vcf \
--out test1/test1 \
--tag-group CB --tag-UMI UB --cap-BQ 40 --min-BQ 13 --min-MQ 20 --min-TD 0 --excl-flag 3844 --min-total 0 --min-uniq 0 --min-snp 0 \
popscle demuxlet \
--plp test1/test1 \
--vcf donor_genotype_chr21.vcf \
--out test1 \
--field GT --geno-error-offset 0.1 --geno-error-coeff 0.0 --r2-info R2 --min-mac 1 --min-callrate 0.50 --alpha 0.1,0.2,0.3,0.4,0.5 --doublet-prior 0.5
popscle freemuxlet \
--plp test1/test1 \
--out test1 \
--nsample 2 \
--doublet-prior 0.5 --geno-error 0.1 --bf-thres 5.41 --frac-init-clust 1.0 --iter-init 10 --seed 0
test1.best (head from the demuxlet result)
INT_ID BARCODE NUM.SNPS NUM.READS DROPLET.TYPE BEST.GUESS BEST.LLK NEXT.GUESS NEXT.LLK DIFF.LLK.BEST.NEXT BEST.POSTERIOR SNG.POSTERIOR SNG.BEST.GUESS SNG.BEST.LLK SNG.NEXT.GUESS SNG.NEXT.LLK SNG.ONLY.POSTERIOR DBL.BEST.GUESS DBL.BEST.LLK DIFF.LLK.SNG.DBL
0 AAACGCTGAAGATG-1 2 2 AMB jurkat,jurkat,0.10 0.00 293T_RTG,293T_RTG,0.10 0.00 0.00 -1.8 1 jurkat 0.00 293T_RTG 0.00 0.16667 jurkat,jurkat,0.00 -1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00 1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00
1 AAAGATCTGCGTTA-1 4 5 AMB jurkat,jurkat,0.10 0.00 293T_RTG,293T_RTG,0.10 0.00 0.00 -1.8 1 jurkat 0.00 293T_RTG 0.00 0.16667 jurkat,jurkat,0.00 -1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00 1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00
2 AAAGCCTGTCACGA-1 2 3 AMB jurkat,jurkat,0.10 0.00 293T_RTG,293T_RTG,0.10 0.00 0.00 -1.8 1 jurkat 0.00 293T_RTG 0.00 0.16667 jurkat,jurkat,0.00 -1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00 1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00
3 AAATACTGACACAC-1 5 8 AMB jurkat,jurkat,0.10 0.00 293T_RTG,293T_RTG,0.10 0.00 0.00 -1.8 1 jurkat 0.00 293T_RTG 0.00 0.16667 jurkat,jurkat,0.00 -1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00 1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00
5 AAATCAACTCAGGT-1 6 7 AMB jurkat,jurkat,0.10 0.00 293T_RTG,293T_RTG,0.10 0.00 0.00 -1.8 1 jurkat 0.00 293T_RTG 0.00 0.16667 jurkat,jurkat,0.00 -1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00 1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00
6 AAATGGGAGAATCC-1 1 1 AMB jurkat,jurkat,0.10 0.00 293T_RTG,293T_RTG,0.10 0.00 0.00 -1.8 1 jurkat 0.00 293T_RTG 0.00 0.16667 jurkat,jurkat,0.00 -1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00 1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00
7 AAATGTTGCTGAAC-1 6 8 AMB jurkat,jurkat,0.10 0.00 293T_RTG,293T_RTG,0.10 0.00 0.00 -1.8 1 jurkat 0.00 293T_RTG 0.00 0.16667 jurkat,jurkat,0.00 -1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00 1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00
8 AACAATACTCGATG-1 6 9 AMB jurkat,jurkat,0.10 0.00 293T_RTG,293T_RTG,0.10 0.00 0.00 -1.8 1 jurkat 0.00 293T_RTG 0.00 0.16667 jurkat,jurkat,0.00 -1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00 1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00
9 AACACTCTTAGCCA-1 2 2 AMB jurkat,jurkat,0.10 0.00 293T_RTG,293T_RTG,0.10 0.00 0.00 -1.8 1 jurkat 0.00 293T_RTG 0.00 0.16667 jurkat,jurkat,0.00 -1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00 1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00
10 AACAGCACCGTGTA-1 2 2 AMB jurkat,jurkat,0.10 0.00 293T_RTG,293T_RTG,0.10 0.00 0.00 -1.8 1 jurkat 0.00 293T_RTG 0.00 0.16667 jurkat,jurkat,0.00 -1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00 1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00
12 AACATTGATCCTGC-1 9 13 AMB jurkat,jurkat,0.10 0.00 293T_RTG,293T_RTG,0.10 0.00 0.00 -1.8 1 jurkat 0.00 293T_RTG 0.00 0.16667 jurkat,jurkat,0.00 -1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00 1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00
13 AACCCAGAGACTAC-1 1 1 AMB jurkat,jurkat,0.10 0.00 293T_RTG,293T_RTG,0.10 0.00 0.00 -1.8 1 jurkat 0.00 293T_RTG 0.00 0.16667 jurkat,jurkat,0.00 -1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00 1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00
14 AACCGATGAAAACG-1 5 8 AMB jurkat,jurkat,0.10 0.00 293T_RTG,293T_RTG,0.10 0.00 0.00 -1.8 1 jurkat 0.00 293T_RTG 0.00 0.16667 jurkat,jurkat,0.00 -1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00 1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00
15 AACCGCCTATTCGG-1 8 16 AMB jurkat,jurkat,0.10 0.00 293T_RTG,293T_RTG,0.10 0.00 0.00 -1.8 1 jurkat 0.00 293T_RTG 0.00 0.16667 jurkat,jurkat,0.00 -1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00 1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00
16 AACCGCCTGTATGC-1 6 8 AMB jurkat,jurkat,0.10 0.00 293T_RTG,293T_RTG,0.10 0.00 0.00 -1.8 1 jurkat 0.00 293T_RTG 0.00 0.16667 jurkat,jurkat,0.00 -1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00 1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00
17 AACGCATGTGAGAA-1 4 4 AMB jurkat,jurkat,0.10 0.00 293T_RTG,293T_RTG,0.10 0.00 0.00 -1.8 1 jurkat 0.00 293T_RTG 0.00 0.16667 jurkat,jurkat,0.00 -1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00 1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00
18 AACGGTTGAATCGC-1 6 7 AMB jurkat,jurkat,0.10 0.00 293T_RTG,293T_RTG,0.10 0.00 0.00 -1.8 1 jurkat 0.00 293T_RTG 0.00 0.16667 jurkat,jurkat,0.00 -1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00 1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00
19 AACGTGTGCGTTGA-1 5 5 AMB jurkat,jurkat,0.10 0.00 293T_RTG,293T_RTG,0.10 0.00 0.00 -1.8 1 jurkat 0.00 293T_RTG 0.00 0.16667 jurkat,jurkat,0.00 -1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00 1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00
20 AACTACCTAGAGGC-1 3 3 AMB jurkat,jurkat,0.10 0.00 293T_RTG,293T_RTG,0.10 0.00 0.00 -1.8 1 jurkat 0.00 293T_RTG 0.00 0.16667 jurkat,jurkat,0.00 -1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00 1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00
21 AACTCGGAGCGATT-1 1 1 AMB jurkat,jurkat,0.10 0.00 293T_RTG,293T_RTG,0.10 0.00 0.00 -1.8 1 jurkat 0.00 293T_RTG 0.00 0.16667 jurkat,jurkat,0.00 -1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00 1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00
22 AACTCTTGATGACC-1 4 5 AMB jurkat,jurkat,0.10 0.00 293T_RTG,293T_RTG,0.10 0.00 0.00 -1.8 1 jurkat 0.00 293T_RTG 0.00 0.16667 jurkat,jurkat,0.00 -1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00 1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00
23 AAGAAGACTTTACC-1 3 8 AMB jurkat,jurkat,0.10 0.00 293T_RTG,293T_RTG,0.10 0.00 0.00 -1.8 1 jurkat 0.00 293T_RTG 0.00 0.16667 jurkat,jurkat,0.00 -1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00 1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00
24 AAGCGACTAAAAGC-1 6 6 AMB jurkat,jurkat,0.10 0.00 293T_RTG,293T_RTG,0.10 0.00 0.00 -1.8 1 jurkat 0.00 293T_RTG 0.00 0.16667 jurkat,jurkat,0.00 -1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00 1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00
25 AAGTCCGAAATCGC-1 1 1 AMB jurkat,jurkat,0.10 0.00 293T_RTG,293T_RTG,0.10 0.00 0.00 -1.8 1 jurkat 0.00 293T_RTG 0.00 0.16667 jurkat,jurkat,0.00 -1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00 1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00
26 AAGTCCGAAGAACA-1 3 3 AMB jurkat,jurkat,0.10 0.00 293T_RTG,293T_RTG,0.10 0.00 0.00 -1.8 1 jurkat 0.00 293T_RTG 0.00 0.16667 jurkat,jurkat,0.00 -1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00 1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00
27 AAGTTCCTCAAGCT-1 4 4 AMB jurkat,jurkat,0.10 0.00 293T_RTG,293T_RTG,0.10 0.00 0.00 -1.8 1 jurkat 0.00 293T_RTG 0.00 0.16667 jurkat,jurkat,0.00 -1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00 1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00
28 AATACCCTGTACAC-1 2 2 AMB jurkat,jurkat,0.10 0.00 293T_RTG,293T_RTG,0.10 0.00 0.00 -1.8 1 jurkat 0.00 293T_RTG 0.00 0.16667 jurkat,jurkat,0.00 -1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00 1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00
29 AATAGGGATTCATC-1 2 3 AMB jurkat,jurkat,0.10 0.00 293T_RTG,293T_RTG,0.10 0.00 0.00 -1.8 1 jurkat 0.00 293T_RTG 0.00 0.16667 jurkat,jurkat,0.00 -1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00 1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00
30 AATCCGGATGTAGC-1 2 2 AMB jurkat,jurkat,0.10 0.00 293T_RTG,293T_RTG,0.10 0.00 0.00 -1.8 1 jurkat 0.00 293T_RTG 0.00 0.16667 jurkat,jurkat,0.00 -1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00 1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00
31 AATCCTACCCCTCA-1 2 2 AMB jurkat,jurkat,0.10 0.00 293T_RTG,293T_RTG,0.10 0.00 0.00 -1.8 1 jurkat 0.00 293T_RTG 0.00 0.16667 jurkat,jurkat,0.00 -1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00 1000000000000000052504760255204420248704468581108159154915854115511802457988908195786371375080447864043704443832883878176942523235360430575644792184786706982848387200926575803737830233794788090059368953234970799945081119038967640880074652742780142494579258788820056842838115669472196386865459400540160.00